西安交通工程学院的前身是西安科技商贸职业学院，2007年开办城市轨道交通运营管理高职专业，先后由电子工程系和轨道交通系管理。2012年，成立了交通运输系，将城市轨道交通运营管理专业划归交通运输系管理。

2014年，学校升格为本科院校，更名为西安交通工程学院，交通运输专业2014年开始招生。2016年成立交通运输学院。2018年交通运输专业获学士学位授予权，2019年交通运输专业获批省级一流专业建设点，交通运输实验教学中心获批省级实验教学中心；铁路行车组织基础获批省级2019年线下一流课程。

学院目前设有交通运输一个本科专业，在校生共1586人。学院师资力量雄厚，自有教师中博士、硕士占比70.13%，专任教师占比79%，正高及副高占比31.77%。

学院拥有完善的教学管理体系，下设四个教研室和交通运输实验教学中心教学管理机构；设有教学、学术、学位三个分委员会和教学督导组。其中教学委员会吸纳行业专家担任委员。

交通运输实验教学中心建筑面积3282.82㎡，实验实训设备415台套，总价值1338.56万元，分布在实验楼A 1、4层。轨道交通类综合实践基地占地面积5400㎡，设施设备总价值280万元，位于校内天佑路两侧。实验实训设备齐全，基本能满足本科教学和教师科研的需要。

拥有国铁集团西安局新丰镇编组站、国铁集团西安局西安西站、国铁集团兰州局银川培训基地、国铁集团西安局宝鸡东站、港铁轨道（深圳）公司、宁波轨道交通有限公司运营分公司、兰州轨道交通有限公司、申嘉有轨电车有限公司、陕西交泰物流有限公司等20多个校外实习基地。